Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F3O00716 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms