Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AGRNO00468 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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