Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIK3C2AO00443 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIK3C2AO00443 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms