Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HHLA1C9JL84 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HHLA1C9JL84 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms