Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLDN25C9JDP6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN25C9JDP6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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