Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX2A2RU54 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms