Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MAP3K4Q9Y6R4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MAP3K4Q9Y6R4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms