Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms