Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP16Q9Y5T5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms