Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNPO3Q9Y5L0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms