Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAXBP1Q9Y5B6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms