Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRXN3Q9Y4C0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms