Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL2Q9Y467 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms