Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMED7Q9Y3B3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms