Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAB39Q9Y376 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms