Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP20Q9Y2K6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms