Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF2A1LQ9UNN4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms