Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CROTQ9UKG9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms