Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCAN3Q9UKA8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms