Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms