Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4Q9UBX2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms