Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSFQ9UBX1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.6 ms