Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPG2Q9UBF2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms