Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MBD2Q9UBB5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms