Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ARHGAP28Q9P2N2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms