Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4Q9P0V3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4Q9P0V3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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