Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms