Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALKBH4Q9NXW9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms