Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms