Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMSN1Q9NSI8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMSN1Q9NSI8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms