Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MMP26Q9NRE1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MMP26Q9NRE1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms