Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB9BQ9NP90 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms