Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLSPNQ9HAW4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms