Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf49Q9H6J7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf49Q9H6J7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms