Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLMPQ9H6B4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms