Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA4CQ9C0C4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms