Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ROPN1BQ9BZX4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ROPN1BQ9BZX4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms