Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCMBPQ9BTE3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCMBPQ9BTE3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms