Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG5

RTBDN, Retbindin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTBDNQ9BSG5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RTBDNQ9BSG5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms