Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERPUD2Q9BSE4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERPUD2Q9BSE4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms