Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOL4Q9BPW4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
APOL4Q9BPW4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms