Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EYA1Q99502 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EYA1Q99502 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms