Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPAN18Q96SJ8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSPAN18Q96SJ8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms