Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A9Q96Q91 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A9Q96Q91 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms