Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALS2CR12Q96Q35 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALS2CR12Q96Q35 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms