Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP4Q96PP9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms