Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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