Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
JSRP1Q96MG2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
JSRP1Q96MG2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms