Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms