Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C9orf72Q96LT7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms